L'Ordre Martiniste fut introduit aux Pays-Bas le 26 septembre 1968, à la demande de Philippe Encausse, le Président de la Fédération des Ordres Martinistes de Paris.

Un membre du Suprème Conseil de l'Ordre Martiniste français, fut désigné comme "Souverain Délégué National" pour les Pays-Bas, le 15 avril 1969 et reçut la mission de répandre les idées, les idéaux et les Initiations Martinistes dans ce pays.
Le 20 février 1970, le Philippe Encausse, comprenant que les enseignements officiels du Martinisme français, imposés au Martinisme depuis Papus, représentait un obstacle considérable en pays Protestant, proposa la fondation d'un Ordre Martiniste indépendant pour les Pays-Bas, pourtant, les membres néérlandais choisirent de rester pour un temps attachés à Paris.
Le premier G* néérlandais fut le Groupe "Jacob Boehme, No 65, Collège d'Amsterdam" qui reçut sa Charte, octroyée par le Suprème Conseil de Paris, le 9 novembre 1970.

Après avoir travaillé en étroite collaboration avec l'Ordre Martiniste français, de nombreux membres néérlandais, de confession Protestante, Vieille-Catholique et Catholique Libérale s'opposèrent au renouvellement du traité d'amitié entre cet Ordre et l'Eglise Gnostique Apostolique, faisant d'elle l'église officielle du l'Ordre Martiniste de Paris.
Ils étaient fortement attirés par les enseignements du Martinisme et éprouvaient des liens profond d'amitié envers Philippe Encausse, alors le Président de la Fédération des Ordres Martinistes, mais voulaient garder une complète liberté de culte et de religion. Philippe Encausse comprit l'importance de la tradition séculaire de liberté religieuse des Pays-Bas et proposa une seconde fois la fondation d'un "Ordre Martiniste des Pays-Bas" indépendant de Paris.

La décision d'indépendance fut prise au cours des "Journées Martinistes" d'Amsterdam le 12 septembre 1974 par la transmission des pouvoirs du Souverain Délégué National de l'Ordre Martiniste français au nouveau Suprème Conseil pour les Pays-Bas. Une nouvelle Déclaration des Principes fut adoptée, et ainsi fut fondé l'Ordre Martiniste des Pays-Bas.

Ce nouveau Conseil fut formé par les Officiers du Groupe original "Jacob Boehme", dont le nom fut changé en "Suprème Conseil de l'Ordre Martiniste des Pays-Bas, No 1, Collège d'Amsterdam". L'ancien Groupe "Jacob Boehme", No 69 devint "Jakob Boehme, Nr 2, Collège d'Amsterdam par la première Charte octroyée par le nouveau Suprème Conseil.

Des circonstances imprévues, mais considérées comme la volonté de l'Invisible ont permis des contacts avec des courants Martinistes autentiques d'Europe centrale et du nord. L'Ordre Martiniste des Pays-Bas devint le dépositaire de filiations éteintes en France et en Belgique. Ces filiations gardées confidentielles remontent sans interruption à Martinez de Pasqually et Louis-Claude de Saint-Martin. Si ces filiations n'ont pas été considérées par les Martinistes français, c'est en grande partie à cause du manque de connaissance de langues étrangères au français de la part de leurs dirigeants. Les trois filiations principales dont l'Ordre Martiniste des Pays-Bas est le dépositaire vinrent des maisons de Hesse-Darmstadt et de Pologne, en passant par les grands initiateurs libres John Yarker, Franz Hartmann et le Prince-Général Michad Tokari Topojevsky.

L'Ordre Martiniste des Pays-Bas n'est limité par aucune juridiction territoriale, mais représente l'une des nombreuses orientations du mouvement Martiniste. Il est en relation étroite avec toutes les autres organisations Martinistes, et accueille avec joie, comme visiteurs à ses réunions, tous les Martinistes qui désirent y assister. L'Ordre national a grandi pour former un Ordre international, comprenant plus de quarante Groupes dans dix pays et sur trois continents.